近海海洋环境科学国家重点实验室（厦门大学）（英文缩写MEL）于2005年3月启动建设，2007年6月通过科技部验收，2010年被评为优秀国家重点实验室。 实验室瞄准与全球变化有关的重大科学问题，直面国家对海洋环境保护和生态安全的重大需求，立足基础研究，以多学科交叉为基础、以技术创新为动力、主攻海洋生物地球化学过程及其与海洋生态系统相互作用，关注在自然变化和人类活动影响下的海洋生态系统对环境变化的响应和反馈。实验室坚持走国际化发展道路，科学研究力求具备国际视野，管理体系参比国际标准，文化建设崇尚自由宽松，努力建设成为具有重要国际影响力的海洋环境科学研究和创新性人才聚集的基地。 实验室现有固定研究人员54人，其中教授31人，副教授、助理教授23人；另有技术人员24人，研究助理64人，行政人员4人。所有固定研究人员均具有海外留学或访问经历，98％具有博士学位。实验室拥有中国科学院院士1人，“长江学者”特聘教授2人，“闽江学者”特聘教授3人，厦门大学特聘教授3人，国家杰出青年基金获得者5人。此外，实验室的一批年轻骨干队伍正在健康成长，已有教育部“新世纪优秀人才支持计划”入选者9人，福建省杰出青年基金获得者2人。实验室还拥有1个国家自然科学基金创新研究群体和1个教育部创新团队。